明朝正德年间，叶国涛在追查一起龙虎山凶杀案时遇害，爱徒董云飞被任命为六扇门捕快，沿着案发现场唯一的证物“令牌碎片”这条线索不断追查，逐渐揭开凶案背后隐藏的有关于古墓宝藏的阴谋。各方势力几次刺杀阻拦董云飞查案，但他置自身危险于不顾，联合知府女儿、方捕快不断深入调查，最终逼得以血虫蛊毒谋财害命的幕后真凶不得不现身，将真相大白于天下。

本影片讲述了明朝中叶，上骑都尉匡天干为达成谋反，私自伪造"大明通行宝钞"并让其所管辖的军队在邻省大肆购买各种物资，一度造成江南物价飞涨、货币贬值的行径让皇帝大怒，派出六扇门彻查，并引发破获江南系列伪造宝钞案件的故事。

武林绝学“血手印”惊现江湖，引出一桩奇案。六扇门最不靠谱的小捕快彭羽天奉命调查，行至洛阳青云阁后，风波频起。彭羽天为了维持六扇门的名声，唯有硬着头皮，从各种刁钻角度进行调查，笑话百出，最终引出一段感人

唐门千金唐小美私逃出门，与江湖术士安东野不打不相识，安东野为讨公道追至六扇门，无意中卷入了六扇门的考核之中。不料，正式的考核还未开始，马上有妇人带着婴儿遭遇蒙面杀手追杀，逃至六扇门。猝不及防之下，婴儿

正德年间，刘瑾独揽朝纲，京城内外数富户家中被盗，凡被盗日，定有一人携金银救济贫苦，百姓尊为“盗圣”。皇帝听此事大发雷霆，命六扇门总捕头雷豹捉拿。雷豹之女雷婷痴迷武功，想闯荡江湖，但父亲反对，她便一气之

明朝中叶，老皇帝昏迷不醒，立储之事悬而未决，皇子和齐王觊觎皇位，明争暗斗，此时京城惊现连环杀人案，责成京师六扇门办理案件，六扇门统带申梓木本想和稀泥，却不想儿子申力行意外卷入案件当中，申梓木被迫带着申