清晨海边，男人侵泡在海水里，像一只死去的美人鱼。蔡湄是水族馆演员，海洋生物学家父亲死于海难后，她一直独自生活，身边只有叔父送她的AI Arctic。一次偶然，她找到父亲生前留下的亚特兰蒂斯研究手稿，于是和Arctic一起开始了对父亲和大海的探索。一路上，她渐渐对Arctic有了异样的感情，可Arctic却突然离开，原来，他的程序里有一段人的记忆。

幽静的水族馆闭馆之际，一个水族管理员在日常清理工作中发现了一个未打开的礼盒。他突然发现一个陌生男孩的身影，两人站在巨大幽蓝的水镜前，开启了心灵对话，彼此陌生，却似曾相识。而这个水族管理员也许正是15年后的那个男孩。

水族箱里诞生了4条小鱼，其中包括哈罗德的女儿伊莎贝尔。伊莎贝尔的身上长着不好看的斑点还缺失了一些鳞片，她的长相遭到鱼群的其他成员嘲笑。鱼群首领瑟斯顿要求哈罗德必须把伊莎贝尔藏起来否则被人来发现将会把他们丢进大海里。贪玩的伊莎贝尔还是被人类发现了，她和哈罗德一起被丢进浩瀚无边的大海里。海上突如其来的巨大风浪使得水族箱里的鱼都掉进大海,一时之间，伊莎贝尔和哈罗德失散了。伊莎贝尔偶遇了艾普尔并结识了一群长相奇特的鱼，它们皆因外在缺陷被同族排挤。在艾普尔的带领下，伊莎贝尔和其它鱼准备穿越火山抵达珊瑚礁寻找哈罗德。

一伙偷猎的歹徒在公海对鲨鱼展开了肆意猎杀，激怒了大白鲨，偷猎歹徒葬身鲨口。转而大白鲨又盯上了游艇上庆祝毕业四个好友，于是四人与大白鲨展开了激烈的搏斗，生死之间，只有逃离鲨口回到岸上的意念能够继续支撑着他们...

影片讲述了发生在贵州省姑鲁产蛋崖的爱情故事，姑鲁为地名。万欣是省城一个成功人士，有着一半的水族血统，他随着旅游团到了水寨后，遇上了他喜欢的水族妹子水秀，水秀是水寨回乡创业的大学生，组织留守妇女开发马尾绣，将马尾绣推出寨门，发展家乡经济。万欣的到来，给水秀开发水家非物质文化遗产：马尾绣、水家九仟酒、水家歌舞水族印象等都带来了很大的帮助，使水秀由衷的佩服，于是两人相恋，但由于传统观念，他们发生了一系列的误会，造成了水秀当众向石神发誓，除非石崖下蛋才嫁给万欣。万欣言不放弃感动了石神，石崖产蛋，万欣和水秀终成眷属