有着用理性的方式思考，讨厌主观判断事物的性格的吉井樱是当地图书馆的新人管理员，每天为客人做着奇妙的参考服务。一天，一位叫芦高礼子的老妇人来到图书馆，展示了一枚旧照片，想去照片中摄影的场所的樱被礼子带去

公元2000年8月，葛城考察队到达南极，发现了地下空洞中的巨大人形生命体Adam以及隆基努斯之枪。葛城计划进行人类基因与Adam融合的接触实验，但不幸因此唤醒了沉睡中的Adam，葛成调查队拼死使用隆基